1、采用聚丙烯酸類阻垢劑時要特別小心在鐵含量較高時可能會引起膜污染，這種污染會增加膜的操作壓力，有效清除這類污染要進行酸洗。
2、如果在預處理中使用了陽離子混凝劑或助濾劑，在使用陰離子性阻垢劑時要特別注意會產生一種粘稠的粘性污染物污染會造成操作壓力增加，而且這種污染物清洗非常困難。
3、阻垢劑阻礙了RO進水和濃水中鹽結晶的生長因而可以容許難溶鹽在濃水中超過飽和溶解度，阻垢劑的使用可代替加酸也可以配合加酸使用，有許多因素會影響礦物質結垢的形成。溫度降低會減少結垢礦物質的溶解度，碳酸鈣除外，與大多數物質相反它的溶解度隨溫度升高而降低，TDS的升高會增加難溶鹽的溶解度，這是因為高離子強度干擾了晶種的形成。
4、理想的添加量和結垢物質及污染物飽和度通過藥劑供應商提供的專用計算軟件來確定。過量添加阻垢劑/分散劑會導致在膜面上形成沉積造成新的污染問題，在設備停機時一定要將阻垢劑及分散劑徹底沖洗出來否則會留在膜上產生污染問題。在用RO進水進行低壓沖洗時要停止向系統注入阻垢劑及分散劑。
5、阻垢劑/分散劑注入系統的設計應該保證反滲透元件之前能夠充分混合，靜態攪拌器是一個非常有效的混合方法。大多數系統的注入點設在RO進水保安過濾器之前，通過在過濾器中的緩沖時間及RO進水泵的攪拌作用促進混合。如果系統采用加酸調節pH推薦加酸點要在上游足夠遠的地方在到達阻垢劑/分散劑注入點之前已經完全混合均勻。
6、注入阻垢劑/分散劑的加藥泵要調到注射率建議的注射率是5秒鐘一次 ，阻垢劑/分散劑的典型添加量為2-5ppm，為了讓加藥泵以高頻率工作需要對藥劑進行稀釋。阻垢劑/分散劑商品有濃縮液也有固體粉末，稀釋了的阻垢劑/分散劑在儲槽中會被生物污染污染的程度取決于室溫和稀釋的倍數。推薦稀釋液的保留時間在7-10天左右，正常情況下未經稀釋的阻垢劑/分散劑不會受到生物污染。選擇阻垢劑/分散劑的另外一個主要問題是要保證與反滲透膜完全兼容，不兼容藥劑會造成膜的不可逆損壞。